Столкнулся с той же проблемой. Версия MIKOPBX была 2020.1.62. Пытался обновить через веб-консоль - после перезагрузки вижу ту же версию. Тогда скачал версию 2020.1.124, обновил через консоль загрузившись с нее и установив поверх. Перестали работать исходящие. Вызовы идут но никуда не приходят. Просто слушаешь гудки, думаешь что не берут трубку, а на той стороне то ничего и не звонит. Установил чистую версию 2020.1.62. Загрузил бэкап. Всё вернулось обратно. Через консоль обновил до версии 2020.1.72. Без изменений. Также обновил до 2020.1.124. И всё заработало нормально как должно. Звонки не рвутся, исходящие работают.
Кстати несмотря на NAT пришлось добавить правило в микротике разрешающее форвард с адреса астериска на порт 5060, без этого исходящие то работали, то не работали.